阿罗拉地区美乐美乐岛某处，一只夜黑魔人与一只索罗亚克对战。
“恶波动。”两只神奇宝贝的主人同时下达命令，显然是想决出胜负，而这两只神奇宝贝的主人分别是真司和格拉吉欧。
【资料图】
原来，是格拉吉欧为了这次阿罗拉联盟大赛在森林里训练，因为格拉吉欧之前已经完成诸岛巡礼的挑战，所以只要去岛屿之王或岛屿女王说明情况就可以了，在训练时偶遇了刚刚完成乌拉乌拉岛的大考验的真司，当两人得知对方都要挑战这次阿罗拉联盟大赛，于是他们来一场练习赛。
回到现在，两道恶波动相碰，最后还是真司的夜黑魔人更胜一筹，最终虽然夜黑魔人在左边，还是对波战胜了索罗亚克，索罗亚克被打成重伤倒在地上，眼睛点起蚊香。
格拉吉欧收回重伤的索罗亚克，真司也收回夜黑魔人。
格拉吉欧对真司说到：“你还真是厉害啊真司，不愧是游历七个地区的训练家。”
真司回到：“你的实力也不差，如果你也外出旅行历练，一定会更厉害的。”
格拉吉欧伸出手说到：“我们联盟赛上再战吧。”
真司握住格拉吉欧的手说到：“好。”
真司与格拉吉欧分别了，真司要回去陪芽衣，格拉吉欧也回去为索罗亚克治疗，另外还有一件重要的事情要办。
格拉吉欧回到家后，在为索罗亚克治疗，莫恩看着被打成重伤的索罗亚克说到：“这是怎么回事？索罗亚克怎么伤成这个样子？”
“我今天在森林里遇见了一个训练家，说是要参加这次的联盟大会，所以我就与他来了一场对战。”格拉吉欧回答到。
莫恩继续问到：“那位训练家很厉害吗？”
格拉吉欧：“确实很厉害，不然我也不会败得怎么惨了。”
“父亲，哥哥你们怎么还在这啊？”露莎米奈此时走了，看见受伤的索罗亚克，“啊，索罗亚克怎么伤成这个样子了？”
“原来是这样啊。”格拉吉欧把自己和真司对战的事给露莎米奈讲了一遍。
莫恩问露莎米奈：“有什么事吗？”
露莎米奈：“对了，刚刚莉莉艾打电话回来了，说她今天要和小智还有小光莎莉娜就要回阿罗拉，估计现在应该要到了，我和库库伊博士商量好给在宝可梦学校给他们准备欢迎会，我是来问问你们要不要也去。”
莫恩：“当然要去，这可是阿罗拉初代冠军归来。”
格拉吉欧：“我也要去。”
露莎米奈：“那就麻烦你们去机场接下机，我先去宝可梦学校和他们一起准备欢迎会。”
宝可梦学校，小智在阿罗拉地区的同学们都聚集在此，本来准备好去接小智的，然而这个时候树枕尾熊敲响大钟——究极防卫队出动，为小智准备欢迎会的事只能先搁置，立即出动。
众人来到究极防卫队的基地。
露莎米奈也进入工作状态，还是像以前一样布置任务，不过这次的情况特殊：第一，是因为没有小智和莉莉艾，所以有格拉吉欧替上，第二，这来到究极异兽有四只——爆肌蚊、费洛美螂、纸御剑和一只看起好眼熟的四颚针龙。
几人分配到任务，卡奇去对付爆肌蚊；玛奥，马玛内去对付费洛美螂；水莲去对付四颚针龙；格拉吉欧去对付纸御剑。众人出发了。
机场——
小智，小光，莎莉娜，莉莉艾来到阿罗拉，刚刚走出机场。
小光莎莉娜莉莉艾一起嗅了嗅空气，小光：“不愧是旅游的圣地。”
莎莉娜：“空气，好清新啊。”
莉莉艾：“故乡的味道，阿罗拉我回来了。”
小智此时东瞧瞧西看看：“不是说好来接我们的吗？怎么不见人呢？”
这时，一个白色的身影突然从他们面前跑过撞倒不少人，莎莉娜：“刚刚那是什么，好快的速度。”
莉莉艾：“究极异兽——费洛美螂。”
小光/莎莉娜：“究极异兽？”
“待会再说，出来吧蜥蜴王，抓住它。”小智见两人疑惑并没回答，而是派出蜥蜴王去追击费洛美螂。
蜥蜴王不愧是小智手中六大王牌之一，很快追上并拦住费洛美螂，费洛美螂见蜥蜴王突然出现在它面前，于是立刻改变方向，然而蜥蜴王速度更快，利用电光一闪立马又拦住他面前，费洛美螂见蜥蜴王又出现在它面前于是不停的改变方向，但蜥蜴王总是能出现它面前。费洛美螂一直逃却逃不掉，所以干脆奋力一战，所以双手汇聚紫色能量，发出信号光束，蜥蜴王使出了刀叶冲向费洛美螂，蜥蜴王使用左手上的刀叶切开信号光束，在接近费洛美螂用右臂上的刀叶斩向它，费洛美螂倒在地上，这时小智小光莎莉娜用传送门赶来过来，看见倒在地上的费洛美螂，对着蜥蜴王说：“辛苦你了，回来休息吧。”小智收回蜥蜴王，小光和莎莉娜看了看费洛美螂，小光：“这就是究极异兽啊。”莎莉娜：“长得挺好看的吗。”
“小智！好久不见。”此时追击费洛美螂玛奥和马玛内看见小智。
马玛内用究极之球收服了费洛美螂几人相互打了招呼做了自我介绍。
小智：“玛奥，马玛内怎么这次只有你们两个，其他人呢？”
玛奥：“是这样的，这次来了整整四只究极异兽。”
小智：“什么四只？”
马玛内：“是的，除了这只费洛美螂，还有爆肌蚊，纸御剑，四颚针龙。卡奇去对付爆肌蚊，格拉吉欧去对付纸御剑，水莲去对付四颚针龙。”
“这样啊，既然如此，那马玛内你去帮卡奇，我和莉莉艾去帮水莲，玛奥麻烦你带小光和莎莉娜去究极防卫队的基地。”小智了解大致情况对玛奥马玛内说到，又把手放在小光莎莉娜的肩膀上说到，“你们两个在我们基地等我。”
小光/莎莉娜：“为什么莉莉艾可以跟着你去？”
小智：“因为莉莉艾也是究极防卫队的成员。”随后，小智派出了比雕，和莉莉艾一起去找水莲。
另一边，格拉吉欧骑着音波龙寻找纸御剑，他以被连切的树木，广告牌之类沿途寻找，而他找到纸御剑，还遇到了……
格拉吉欧：“真司！”
原来是上午才与自己一战的真司，他见到纸御剑是他从没有见过的神奇宝贝，而且他用暗能量感应到一股不属于这个世界的气息，所以准备收服他。真司看到是上午才与自己一战的格拉吉欧：“是你，你怎么在这？”
格拉吉欧将究极防卫队和纸御剑是究极异兽的事都告诉了真司。真司表示：“既然如此，那我就更要收服他了。纸御剑我要收服接受我的挑战吧。”
纸御剑挥动如尖刀的双手表示——放马过来。
格拉吉欧见状，拿出一颗究极球叫给了真司。
真司：“这是什么？”
格拉吉欧：“这是专门用来捕捉究极异兽的神奇宝贝球，可以保证一次收服成功。你就用这个来收服吧。”
“好的。”真司收下究极球，派出自己的神奇宝贝，“烈咬陆鲨，准备出来战斗。”真司派出自己的烈咬陆鲨。
真司：“使用龙爪。”烈咬陆鲨的爪子伸出绿光，纸御剑将双臂叠在一起使出圣剑，两只神奇宝贝都接住对方的攻击。
真司：“推开它。”
烈咬陆鲨推开纸御剑。纸御剑展开双臂汇聚阳光，准备使用阳光烈焰{纸御剑是草+钢}。
真司：“烈咬陆鲨，使用龙之波动。”烈咬陆鲨从口中吐出幻彩紫的龙形光线与纸御剑的阳光烈焰对抗，显然烈咬陆鲨的更强，龙之波动打中了纸御剑，真司抓住机会，下令道：“烈咬陆鲨使用电光一闪再用劈瓦。”烈咬陆鲨瞬间飞到纸御剑身后，用劈瓦将纸御剑打到地上。真司丢出了究极球砸中了纸御剑，将其收入球中，球摇晃几下，最后停下来——成功收服。
然后，卡奇用老办法——比摆肌肉poss，趁机扔球收服爆肌蚊，四颚针龙就是小智的四颚针龙本来就是为了再次追随小智才跟着那几个跑过来的，遇见小智自然就轻松收回。{欢迎四颚针龙归队}
最后，回到原来世界只有费洛美螂，爆肌蚊，而纸御剑被真司留下，四颚针龙回归小智的队伍，所以留在这边。
至于小智的欢迎会吗。只能延后了。
下回继续——
别别走啊还有彩蛋
片尾彩蛋：
在一个遥远的地方，小(gou)豪正在躲避追杀，追杀他的是蓝色头发，长着猫耳，周围附有若干金色光片，长着尾端为十字星的尾巴，手持金色宝剑的人？神奇宝贝？
这个人变出蓝色印有冰系图案的圆形晶片，放入剑身和剑柄出的圆形凹槽中。
“别想跑。”追杀者用瞬间移动跑到小(gou)豪面前，“接招吧，极冰之刃。”追杀者后拉宝剑，周围出现大量冰锥，向前一冲，一根根冰锥刺穿了小(gou)豪的身体，全身凝固。随后追杀者有变出一个太极图案的黑白色晶片换下原本的冰系晶片，“光影绝杀。”追杀者带着龙形能量冲过了小(gou)豪的身体，最终小(gou)豪的身体破碎。追杀者变出一张金紫交加的光网兜住了一只生物，一发光刃解决了他。
随后，追杀者看着小(gou)豪身体被毁灭前站立的地方，自言自语到：“可怜的家伙，谁让你犯下七宗罪，让这家伙附体，最终弄得肉体不剩渣，灵魂被吸干净呢。不过你放心，为了不让你的家人朋友伤心，我会将他们有关你的记忆都清除干净的，你在这个世界所有相关的物品消除，就像你从来没有存在过一样。
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